胡椒疫病：也称胡椒瘟，为真菌性病害。为害蔓基部，之后蔓延至全株，木质部迅速腐烂，植株突然凋萎死亡。死亡时，根部大部分完好。本病一般以预防为主。防治方法：疏通排水沟，保证胡椒园不积水；做好摘花、摘叶工作，使椒头通风透气；发现病株及时拔除烧毁，并对病穴进行消毒；在该病流行初期，加强椒园管理，增强植株的抗病能力；药剂防治可以选用雷多米尔、普力克、乙磷锰锌等药剂防治。

叶斑病：主要为害叶片。开始发病时，病斑为多角形水渍状，病斑扩大后中间深褐色或淡褐色，边缘变黄，湿度大时有浓液滴从病斑处溢出。该病可使植株落叶、落花、落果，病蔓干枯。防治方法：尽快摘除病叶；用75%百菌清可湿性粉剂600倍液或达科宁等药剂防治，一般7～10喷1次，连续喷药3～4次。

病毒性花叶病：由病毒引起的病害。受害植株叶变小卷曲，节间变短，植株矮小畸形，结果少而小；也有的植株仅使叶片变为花叶，其他部位基本生长正常。防治方法：加强管理，合理施肥，提高植株抗病力；发现病株拔除烧毁；药剂防治可选用病毒必克、83-Ⅱ增抗剂等防治。